מגפת אתונה שפרצה בשנת 430 לפני הספירה הביאה למותם של בין 75,000 ל-100,000 בני אדם בתוך שנים ספורות.
המחלה נכנסה לעיר דרך נמל פיראוס בעיצומה של מלחמת פלופונסוס והתפשטה במהירות שגרמה לאובדן של כ-25 אחוז מכלל האוכלוסייה.
תוקידידס תיעד את האירועים וציין כי לא נזכרה מגפה כה קטלנית בכל מקום.
οὐ μέντοι τοσοῦτός γε λοιμὸς οὐδὲ φθορὰ οὕτως ἀνθρώπων οὐδαμοῦ ἐμνημονεύετο γενέσθαι. οὔτε γὰρ ἰατροὶ ἤρκουν τὸ πρῶτον θεραπεύοντες ἀγνοίᾳ, ἀλλ’ αὐτοὶ μάλιστα ἔθνῃσκον ὅσῳ καὶ μάλιστα προσῇσαν, οὔτε ἄλλη ἀνθρωπεία τέχνη οὐδεμία· ὅσα τε πρὸς ἱεροῖς ἱκέτευσαν ἢ μαντείοις καὶ τοῖς τοιούτοις ἐχρήσαντο, πάντα ἀνωφελῆ ἦν, τελευτῶντές τε αὐτῶν ἀπέστησαν ὑπὸ τοῦ κακοῦ νικώμενοι.
התיאור מדגיש את כישלון הרופאים, שמתו בשיעורים הגבוהים ביותר משום שבאו במגע קרוב עם החולים, ואת חוסר התועלת של כל אמצעי אנושי אחר.
תפילות במקדשים ופנייה למגידי עתידות לא הביאו כל תועלת, ולבסוף נטשו האנשים גם את המנהגים הללו.
מחקר DNA שבוצע בשנת 2005 על ידי מנוליס פפגריגורקיס על דגימות משיניים שנמצאו בקבר המוני בכרמיקה זיהה את החיידק Salmonella enterica כגורם הסביר ביותר למחלה.
הממצאים מצביעים על קדחת טיפוס כהסבר העיקרי לתסמינים שתוארו.
במאי 2025 פרסם החוקר פ. דומינגו סקירה בכתב העת Clinical Microbiology and Infection שבה הוא בוחן מחדש את התיאור ההיסטורי דרך עדשות מיקרוביולוגיות ומציע השערות אבחנתיות חדשות.
דומינגו כותב כי הסקירה מעריכה מחדש את ההשערות המסורתיות לאור נתונים עדכניים.
המגפה פגעה קשות ביכולת הלחימה של אתונה והשפיעה על המורל הציבורי במהלך העימות הממושך עם ספרטה.
קברי ההמונים בכרמיקה מספקים עדות פיזית להיקף האבידות ולדרך שבה התמודדה החברה עם מספר כה גבוה של מתים.
